近日,我院教師唐春豔工程師、鐘誠教授、澳门太阳集团9728网站生命科學與技術學院王勉副教授、吉林大學計算機學院周豐豐教授的研究論文“FMGNN: A method to predict compound protein interaction with pharmacophore features and physicochemical properties of amino acids”被IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics期刊錄用,且已經在線發表(DOI: 10.1109/TCBB.2022.3172340)。IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics是中國計算機學會CCF推薦的綜合交叉學科生物信息計算領域頂級期刊。
藥物靶點相互作用關系預測是藥物發現的關鍵環節。該論文提出了一種新穎的因子分解機(Factorization Machines)和圖神經網絡(Graph Neural Network)的混合模型FMGNN,綜合利用輸入的高低階特征來提升模型在稀疏關系數據中的預測準确度,并進一步結合藥物藥效團特征和蛋白質靶标物化性質,設計計算機算法将其應用于求解藥物靶點相互作用預測問題。目前,FMGNN方法的研究結果已在生物醫藥領域得到應用。
